Team Galactic

Megpróbálják elcsábítani és az irányításuk alá vonni az emberek pokémonjait és rávenni a sinnohi pokémon-professzort, hogy segítse őket a kutatásaival. A régebbi bűnözőbandákkal ellentétben a Team Galactic létezése nyilvánosan hirdetett tény, még tévés reklámokat is gyártanak, melyekben pokémonadományt kérnek, azonban rossz szándékukat nem tárják nyilvánosság elé. A Team Galactic el akarja kapni azt a 2 pokémont (ugyanúgy, amilyen sikeresen elfogták Merspit-et, Uxie-t, Azelf-et), akik létrehuzták a világot: Dialga-t (az időt hozta létre) és Palkia-t (a teret), így az ő vezetőjük, Cyrus a világ uraként lerombolhatja, majd saját elképzelései szerint újra megteremtheti az univerzumot. Azonban ezt csak Cyrus és a  Commander-ek tudják, az átlagemberek azt hiszik, hogy ez egy ritka pokémonokat gyűjtő szervezet. A csapat legnagyobb része a nekik ígért, a sikeres küldetés után átadandó ritka pokémonok miatt csatlakozott. 

Cyrus

Cyrus a Team Galactic vezetője. Minden érzelmet figyelmen kívül hagy, mert szerinte azok gyenge emberi szív tulajdonságai. Célja, hogy istenként újrateremtse az univerzumot. Sunyshore városban született és nőtt föl egy idős házaspár mellett. Gyerekként kitűnő tanuló volt, ugyanakkor nagyon antiszociális - az embereknél is jobban szerette a robotok, gépek világát. A játékos először az Mt. Coronet-nél találkozik vele, de nem harcolnak és még a nevét se tudja meg. Később a Valor tavat őrző 2 ember említi meg a nevét, bár ekkor még nem tudjuk azt személyhez kötni, amíg ténylegesen meg nem küzdünk vele először, a Galactic Veilstone Buildingben. 

Commanderek:

Mars

Először a 204 útnál láthatjuk, amikor csapatával irányításuk alá akarják vonni a Valley Windworks-t. Mars a Verity tónál is feltűnik . Végül a Spear Pillar-nál (Jupiterrel) próbálja fékezni a játékost, hogy Cyrus föl tudja ébreszteni a legendás pokémont.  

Jupiter

Először a Galactic Building legfelső szintjén találkozunk vele, Eterna városban. Aztán rövid ideig látjuk az Acuity tónál, ahol meglehetősen könnyen legyőzi a riválisunkat. Egy Mars-sal való duplacsatában harcolunk ellene a Spear Pillar-nál, ahol a riválisunk segít minket.

Saturn

Először a Valor tónál látjuk Pastoria város közelében. Harcolunk vele Azelf barlangjában és megtudjuk, hogy Mars a Verity tónál van.